為配合政府相關防疫措施，並以旅客健康安全為優先考量，台灣高鐵公司今年將超前部署各項防疫作為，於 2020「清明假期疏運」期間（4/1-4/6），所有車次一律實施全車對號座，並暫停定期票、回數票、悠遊卡/一卡通聯名卡的使用，就是要降低感染風險；台灣高鐵清明假期疏運自 3 月 5 日（四）凌晨 00:00 起開放預售，提醒旅客特別注意、提早訂位購票，並依照票面所載之車次及車廂座位搭乘，以免無法乘車。
台灣高鐵清明假期疏運規劃加開 184 班次列車（南下 79 班、北上 105 班），總計 6 天提供 1,050 班次列車、103 萬 8450 個座位的旅運服務；旅客可自 3 月 5 日（四）凌晨零時起，透過「T Express」行動購票系統、高鐵合作之便利超商、網路訂票系統、語音訂位系統，或於車站營業時間至售票窗口及自動售票機，一次預購清明假期疏運期間所需的車票。
高鐵公司特別提醒，4 月 1 日（三）以及 4 月 6 日（一）兩天為上班日，旅客仍有上班通勤的需求，敬請旅客提早訂票，以免耽誤上班行程。
高鐵公司並將針對持有定期票、回數票之旅客，提供以下配套措施：
一、 定期票：原優惠效期含 4 月 1 日至 4 月 6 日者，將配合展延相對應天數；此外，4 月 7 日 ~ 4 月 8 日 2 天除維持定期票使用外，特別再加碼展延 2 天優惠效期，也就是總共展延 8 天。譬如，原定期票效期為 3 月 20 日 ~ 4 月 18 日，經展延 8 天後，優惠效期將至 4 月 26 日。如果旅客退票不收回已使用天數的折扣，且不收手續費，並退還製卡費。
二、 回數票：除同上述規定展延回數票 8 天優惠效期外，於 3 月 31 日 (含) 前購買回數票且於 4 月 7 日至 6 月 6 日將回數票次數在效期內使用完畢者，可於 2020 年 6 月 30 日前，持符合優惠資格之回數票至各車站售票窗口換購同區間半價自由座車票1張。所換購的自由座車票不可變更且限兌換當日有效，如辦理退票，原優惠資格不予返還。
清明假期疏運期間仍將提供「大學生優惠」及「早鳥優惠」，旅客於搭車日前 5 至 28 天購票，就有機會享有早鳥 65 折、8 折或 9 折優惠。疏運期間適用「標準車廂卡友優惠」及「商務車廂限量升等」等專案，但「25 人以上團體」及「校外教學」等專案則暫不適用。
台灣高鐵為維護旅客健康，各車站服務台均備有消毒酒精、額溫槍與疾管署防疫文宣，各車站也持續針對旅客較常接觸之設備，例如：廁所、電扶梯、售票櫃台…等，每 4 小時加強酒精擦拭消毒，並於每日營業結束後，進行車站全面消毒；同時，每天也確實執行列車清潔消毒作業，特別針對旅客接觸頻繁的車廂座位、扶手及餐盤等設施，都以清潔劑加強消毒，敬請民眾安心搭乘。
